FBSコロキウム 217回生殖生物学研究室
| 講演 |
Expression and function of cyclic phosphate-containing RNAs: a hidden layer of the transcriptome 桐野陽平［Thomas Jefferson University］ |
|---|---|
| 日時 | 2019年7月16日（火）15:00～16:00 |
| 場所 | 吹田キャンパス 生命機能研究科 生命システム棟2階 セミナー室 |
| 言語 | 英語 |
| 世話人 |
甲斐歳恵（生殖生物学研究室） |
Expression and function of cyclic phosphate-containing RNAs: a hidden layer of the transcriptome
Cellular RNA molecules contain phosphate or hydroxyl ends. A 2',3'-cyclic phosphate (cP) is one of the 3'-terminal forms of RNAs mainly generated from RNA cleavage by ribonucleases. Although transcriptome profiling using RNA-seq has become a ubiquitous tool in biomedical research, cP-containing RNAs (cP-RNAs) form a hidden transcriptome layer, which is infrequently recognized and characterized, because standard RNA-seq is unable to capture them. Despite cP-RNAs' invisibility in RNA-seq data, increasing evidence indicates that they are not accumulated simply as non-functional degradation products; rather, they have physiological roles in various biological processes, designating them as noteworthy functional molecules. By developing cP-RNA-seq, we revealed comprehensive cP-RNA expression repertoire in cell lines and tissues. In addition to the cP-RNA expression profiles, the role of cP-RNAs in asthma and infectious diseases will be presented and discussed.
実施報告
生命システム棟2Fセミナー室において、第217回コロキウムを開催しました。今回の演者は、米国フィラデルフィアのトーマスジェファーソン大学よりお越しいただいた桐野陽平先生で、「Expression and function of cyclic phosphate-containing RNAs: a hidden layer of the transcriptome」というタイトルでお話しいただきました。最近では、塩基配列解析の技術が革新的に進歩しており、細胞内で発現しているRNAの種類と量に関する知見が飛躍的に蓄積されてきた。しかし、一般的に用いられている方法では解析できない特殊なRNAも存在しており、それらは未だ隠れた存在である。桐野先生のグループでは、そのような特殊なRNAのうち、RNAの3'側が環状リン酸化されているものを見出し、その生成機構と生理的機能に関する研究を進めておられます。環状リン酸化RNAは、当初tRNA由来のものが知られていたが、桐野先生らが開発したプロトコールによって、環状リン酸化RNAが網羅的に探索された。その結果、リボソームRNAやmRNAからも、環状リン酸化RNAが生成されることが明らかとなった。環状リン酸化RNAは、ヘアピン様の構造を形成すると考えられるRNA部分で多く見つかっていることから、RNAの立体構造と環状リン酸化RNAの生成機構との関連が示唆される。残念ながら、その生成に必要なRNA切断酵素は、まだ同定されていない。環状リン酸化RNAは、よく研究が進んでいる小分子RNAの1つであるマイクロRNAよりも多く存在していること、エクソソームにも取り込まれていることなどが明らかにされた。さらに、喘息や感染症における環状リン酸化RNAの挙動についても明らかにされており、環状リン酸化RNAの分子機能に迫る内容であった。
