Barkai-Leiblerモデルを考える-04
刺激直後の反応は?
メチル化がX濃度に依存する場合,を考えていきます.
刺激直後にどの程度,Xm*,が変化するのでしょう?
前々ページと同様に,以下のモデル図を考えます.
ここで,
X:レセプター(不活性,非メチル化)
Xm:レセプター(不活性,メチル化)
Xm*:レセプター(活性,メチル化)
となります.
刺激直後には,Xm*,の濃度が下がり,徐々に復活し,元に戻るわけですから,
とような反応になります.
ここで,各反応速度には,
\(\Large \displaystyle k_B, k_R << k_A, k_I \)
となります,適応現象は刺激応答に対してとても遅いことからです
したがって,刺激直後の短期間の反応は,
だけを考えればいいので,
\(\Large \displaystyle k_I \cdot X_m^* \vert_{t \leqq 0} = k_A \cdot X_m \vert_{t \leqq 0} \)
の関係になります(短時間には)
刺激前の,メチル化レセプターの各濃度は,ここ,に示したように(kI=0なので),
\(\Large \displaystyle X_m^* \vert_{t \leqq 0} = \frac{ k_R \cdot R}{k_B \cdot B} \)
\(\Large \displaystyle X_m \vert_{t \leqq 0} = \frac{ k_B \cdot B +0}{k_A} \frac{ k_R \cdot R}{k_B \cdot B} = \frac{k_R \cdot R}{k_A} \)
となりますので,刺激前のメチル化レセプター全濃度は,
\(\Large \displaystyle \left( X_m^* + X_m \right) \vert_{t \leqq 0} = \frac{ k_R \cdot R}{k_B \cdot B} + \frac{k_R \cdot R}{k_A} = k_R \cdot R \left( \frac{1}{k_A} + \frac{ 1}{k_B \cdot B} \right) \)
となります.したがって,
\(\Large \displaystyle X_m \vert_{t \leqq 0} = \frac{k_I}{k_A} X_m^* \vert_{t \leqq 0} \)
\(\Large \displaystyle X_m^* \vert_{t \leqq 0} \left( 1 + \frac{k_I}{k_A} \right) = k_R \cdot R \left( \frac{1}{k_A} + \frac{ 1}{k_B \cdot B} \right) \)
\(\Large \displaystyle X_m^* \vert_{t \leqq 0} \frac{k_A + k_I}{k_A} = k_R \cdot R \frac{k_A + k_B \cdot B}{k_A \cdot k_B \cdot B} \)
\(\Large \displaystyle \begin{eqnarray} X_m^* \vert_{t \leqq 0} &=& k_R \cdot R \frac{k_A + k_B \cdot B}{k_A \cdot k_B \cdot B} \frac{k_A }{k_A+ k_I} \\
&=&
\frac{k_R \cdot R}{k_B \cdot B} \frac{k_A + k_B \cdot B}{k_A+ k_I} \\
\end{eqnarray} \)
となる(はず)です....