実際の反応スキーム
各チャンネルの蛍光強度の比を，FRET ratio(Observed) ，とすると，クロストーク成分がなければ，
\(\Large FRET_{ ratio } (Observed) = \displaystyle \frac{ YFP \ channel}{CFP \ channel} \)
となりますが，クロストーク成分を考えると，反応に基づいたCFPとYFPの蛍光の比は，
\(\Large FRET_{ ratio } = \displaystyle \frac{ YFP \ channel - 0.34 \times CFP \ channel}{CFP \ channel}\)
\(\Large \hspace{70pt} = \displaystyle \frac{ YFP \ channel}{CFP \ channel} - CT \)
となることがわかります．
反応スキーム
CheA, CheY, CheB, Motor, Receptor，更にはリン酸化の反応を考えてみると，結構複雑であることがわかります．
ここで，
A ： CheA
Y ： CheY
B ： CheB
Z ： CheZ
M ： Motor
Re ： Receptor
p ： リン酸化
となります．
こんがらがっっているので，整理すると，
となります．赤文字が今回のFRET計測で関わるところです．
さらに，Victor, Lipkowらのデータを考慮して，赤線だけの4状態に簡略化してみました
それが，Fig.7-A，にある，
となります．
この各状態を，FRETratio，から推定すればいいことになります．
次はこの4状態反応スキームと，FRETratioとの関係，について検証してきましょう．
