Chung-Kennedy filter

詳しくは,オリジナル論文,
 Chung, S. H. & Kennedy, R. A. (1991). Forward-backward non-linear filtering technique for extracting small biological signals from noise. J Neurosci Methods 40, 71-86.
 Leake, M. C., Wilson, D., Gautel, M. & Simmons, R. M. (2004). The elasticity of single titin molecules using a two-bead optical tweezers assay. Biophys J 87, 1112-35.
をご覧ください.
今回は,かみ砕いた説明をさせていただきます.

まずは,実際のChug-Kennedy filter を使った結果から,

ごらんの通り,
 青:Chug-Kennedy filter
 赤:ローパスフィルタ(4Hz,バタワース)
のトレースの拡大図です.
明らかに,立ち上がりがシャープになっていることがわかります.

このようにステップ状の変位が予想される場合には,非常に役に立つ手法です.
もちろん,万能なフィルタではなく,このようなステップ状の変位が予想される場合に有効となります.
また,立ち上がりがシャープになっているからと言って,その部分の情報(サブステップなど)が維持されているかどうかはわかりません.

それでは,このフィルタの原理,使い方を簡単に説明しましょう.

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