Tcellを求める方法が同じ図のDにあります.
Lo et. al., 2006, BJより
ここで,まず背景光のフィッティングを行っています.
図の青い線ですね.
前のページの図のように,解析エリアの中に背景領域も含まれています.
それが,図の2000近傍の強度のピークですね.
一般的に背景光の強度分布はガウス分布で近似できますが,4000あたりを見ればわかるように,背景光とセルの蛍光強度がかぶっています.
そこで,Loらは2000以下の領域(ガウス分布の左半分)でガウス分布の近似を行っています.
そのカーブが,論文に記載されている,
となるのです.
上の図では,
Ibg = 2000
程度でしょうか.
そして,次に,
Tbg
を求めています.
これが問題ですねえ...
論文では,
Tbg=I0
とし,I0,を,
I>Ipeakであり,g(I)が1未満
と定義しています.
問題は,Ipeak,がなんだかわからない....
本人に聞いてみると,
Ipeak=Ibg
と言うことでした.
何のことはない...かみ砕いて言うと...
背景光のフィッティングカーブ,g(I),の値が1以下になったところの強度
でも,それだとフィッティングカーブの左にもあるので,Ibg,というガウス分布の右側を探す
と言うことでした.
そして,肝心の,Tcell,は,
として,細胞の蛍光強度分布の最大と最低の真ん中を取る,というアルゴリズムです.
なんか単純なような,複雑なような....
では,もう少し,違った観点から考えていきましょう.