次に,358ページ,右段の,
RESULTS, Fluorescence Intensity measurements
を読み解きましょう.
ここは,結構ごちゃごちゃしていますが,わかると非常に単純なアルゴリズムです.
ただ,記号が多く,しかも一部の記号の定義がなされていない,という問題があります.
さて,この論文の核となる,
蛍光強度,F
を彼は以下の式で表しています.
ここで,記号が一杯,
I, Ibg, Tcell
ですね..
これは,
領域(蛍光強度がTcell以上のもの)の蛍光強度から,背景光の強度,Ibg
,を引いたものの平均を,蛍光強度,F,とする
と言うものです.
実際の画像を論文から引用しましょう.
Lo et. al., 2006, BJより
Bが実際の画像で,斜めの白枠の部分が計測場所になります.
疑似カラー表示で,白→黄→赤→緑→水色→青→黒,と強度が変化するようですね.
この強度変化を,C,のように三つの領域に分けます.
白:background region 背景領域
赤:marginal region 境界領域
黄:cell area 細胞領域
とし,赤と黄の境界を,Tcell,としています.
つまり,黄色領域の平均を取っています.
実際の強度分布は同じ図の,E,にあります.
Lo et. al., 2006, BJより
この黄色の領域の平均を取っていることになります.
ここで一番重要なのは,
Tcellをどう取るか
と言う点になります.
この点を,次ページで説明しましょう.