具体的な作業としては，5ポイントのデータがある場合，
１，２，３，４，５
間隔１：１と２，２と３，３と４，４と５
間隔２：１と３，２と４，３と５
間隔３：１と４，２と５
間隔４：１と５
の差分の二乗を計算すればいいことになります．
計算は，
データ |
||||||
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
||
デ ー タ |
1 |
1 |
2 |
3 |
4 |
|
2 |
1 |
2 |
3 |
|||
3 |
1 |
2 |
||||
4 |
1 |
|||||
5 |
||||||
この表のように（黒字がデータ番号，赤字は計算する場所で，数字は間隔），全ての組み合わせは必要なく，赤字の部分のみの計算となります．
この間隔ごとの平均を出せばいいのです．
ここで，
間隔が長くなると得られるデータ数が少なくなる
と言うことに注意してください．つまり，
間隔１：４データ
間隔２：３データ
間隔３：２データ
間隔４：１データ
となっていますね．
次に，MSDプロット，を使う場合での注意点を示します．